将施奈德回老家之后，四只原本亲如兄弟的神龟由于没有了敌人，于是不再想以往一样一起战斗，而是各自在喜欢的领域内钻研，以往一起行动的忍者神龟们变成了四个独来独往的“独行侠”！这时，纽约市中发生一连窜的怪事

这是一部经典的美国的动画片。一天，一家工厂泄漏的有毒化学物质流到了纽约市的地下水道，这些化学物质令到四只平凡的小海龟发生了基因突变，变成了像人一样能站立行走的人形海龟，他们分别是米开朗基罗、达芬奇、拉

影片讲述了“海王”饰演的乔·布拉文与父亲（史蒂芬·朗）共渡狩猎假期，没想到竟踏入毒贩藏匿海洛因的窝点，面对疯狂的毒贩，父子二人只能与他们展开殊死搏斗。